В 1913 году Людмила Алексеевна поступила в Санкт-Петербургский женский медицинский институт, однако обучение так и не завершила, уехав весной 1919 года в качестве помощника врача в село Мутасьево Моршанского уезда Тамбовской губернии – там была организована детская трудовая колония. Так как учителей не хватало, Людмила Алексеевна изъявила желание, наряду со своей основной работой, преподавать детям естествознание.
В 1934 году Л.А. Исаенко получила высшее образование, окончив педагогический факультет Вечернего педагогического института при Академия коммунистического воспитания имени Н. К. Крупской.
В 1934 году Людмила Алексеевна начинает работать в Научно-практическом институте специальных школ и детских домов Наркомпроса РСФСР (впоследствии НИИ дефектологии АПН РСФСР) в качестве методиста по естествознанию. Затем была переведена на должность старшего научного сотрудника сектора обучения и воспитания глухонемых детей. Программы для школ глухонемых детей, написанные под руководством Л.А. Исаенко, внесли существенный вклад в изменение методики преподавания в специальных школах
В 1950 году Л.А. Исаенко представляет диссертацию на соискание ученой степени кандидата педагогических наук «Методика преподавания естествознания в школе глухонемых». Исследование Людмилы Алексеевны была одной из первых работ, обобщивших имеющийся практический опыт в этой области. Л.А. Исаенко является автором учебника для 6-го класса школ глухонемых «Жизнь растений».
Людмила Александровна в течение нескольких лет читала лекции по методике преподавания естествознания на курсах повышения квалификации учителей. Ее монография «Методика преподавания естествознания в школе глухонемых» отмечена Президиумом Академии педагогических наук РСФСР премией II степени.
Отмечена наградами: медалями «За доблестный труд в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг.» (1945), «В память 800-летия Москвы» (1947), значком «Отличник народного просвещения» (1957).
- Исаенко Л.А. Об улучшении преподавания естествознания во вспомогательной школе // Учебно-воспитательная работа в специальных школах. - 1940.- Вып. 1. - С. 17-26;
- Ягодовский К.П., Исаенко Л.А. Методика естествознания для вспомогательных школ. - М.: Учпедгиз. 1946. -215 с;
- Исаенко Л.А. Предметные уроки: Руководство для учителей вспом. школы. - М.: Учпедгиз. - 1946.;
- Исаенко Л.А., Акименко И.П., Слезина Н.Ф. Практические работы учащихся школы глухонемых // Под ред. канд. пед. наук С.А. Зыкова; Ин-т дефектологии Акад. пед. наук РСФСР. – М.: Учпедгиз. 1956;
- Исаенко Л.А. Тело человека и охрана его здоровья: Учеб. пособие для 7 класса вспомогательной школы. – М.: Учпедгиз, 1962.